AI技術(shù)新應用:重構(gòu)神經(jīng)元破解大腦的“奧秘”

時間:2021-10-11

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導語:腦是人體最為復雜的器官,揭示腦的奧秘被認為是生命科學研究的“終極疆域”。

  其中,神經(jīng)元作為構(gòu)成神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,不僅是人類探索大腦奧秘,揭開人類行為模式、思考模式的突破口,也對治愈人類神經(jīng)疾病有重要意義。重建神經(jīng)元會讓我們深入了解大腦工作模式。

  不過,這也是一項異常艱巨的工作:每個神經(jīng)元各不相同,又相互交織,同時,它們還會從其他數(shù)千個神經(jīng)元那里接收信息,并與數(shù)千個神經(jīng)元共同輸出信息,科學家常常把神經(jīng)元之間的映射關(guān)系比作復雜的高速公路。

  想要重建神經(jīng)元,我們不僅需要弄清楚每個神經(jīng)元的特質(zhì),更要弄清楚它與其他數(shù)千個神經(jīng)元,在如不同化學藥品、不同行為反饋等情境下信息交換的模式。

  10月7日,國際頂級學術(shù)刊物《Nature》發(fā)布了題為《Morphological diversity of single neurons in molecularly defined cell types》的小鼠大腦神經(jīng)元重構(gòu)的文章。該研究實現(xiàn)了1741個小鼠神經(jīng)元的重建,是目前全球?qū)W術(shù)范圍內(nèi)最大規(guī)模的神經(jīng)元重建;同時還定義出11種具有不同形態(tài)特征和基因表達的主要投射神經(jīng)元類型。

  據(jù)介紹,這項研究成果出了為細胞分類研究提供了科研素材,也為繪制全局網(wǎng)絡(luò)和局部回路圖譜提供了基礎(chǔ)真實信息。

  據(jù)悉,在完整神經(jīng)元形態(tài)重建中,科學家將神經(jīng)元細胞類型準確分類和神經(jīng)元多樣性考慮進實驗,同時還將不同但相關(guān)的細胞特性進行了整合,以獲取更加精確的神經(jīng)元分類和圖譜繪制。

  當然,完成這項工作并不輕松。科學家們需要詳細分析小鼠全腦三維數(shù)據(jù)集,其包含上萬個XY平面的冠狀圖像,使用TeraVR虛擬現(xiàn)實標記系統(tǒng)對3D圖像進行人工標記,來重建每個神經(jīng)元的完整形態(tài)。

  對于2D圖像的標注,科學家只需關(guān)注平面上的點位,相對較為容易;但這項研究是通過VR設(shè)備在3D圖像上做標記,這也意味著科學家們不僅需要了解該標記在基于平面視角上的精確位置,還需要從立體視角精確標記該點位的深度。

  這就如同一個人在3D游戲中想抓住一只飛行在極大空間里的小蟲,用戶雖然可以迅速定位這只小蟲的平面位置,但真正捕捉它的時候卻發(fā)現(xiàn)它在定位空間之外的垂直高空中。這也是人工標注容易出現(xiàn)錯誤的原因。

  因此,所有神經(jīng)元數(shù)據(jù)還需要再讓獨立的科學家進行檢查和勘誤,全部數(shù)據(jù)需要經(jīng)過三輪校驗甚至修正才能得到最終標注結(jié)果,而每個數(shù)據(jù)完成一輪勘誤需要花費至少1小時人工。

  鑒于此,騰訊天衍實驗室針對性地開發(fā)出一種自動的錯誤節(jié)點檢測算法,用AI對人工標注進行自動糾錯。據(jù)介紹,該算法能對包括循環(huán)、間隙和不正確的節(jié)點類型重建錯誤進行自動檢測和基本糾正,并將糾正結(jié)果發(fā)回進行人工核實。據(jù)測算,該算法對單個節(jié)點重建錯誤檢測AUC達到94.9%,準確率達到86.6%。

  當然,對于擁有860億神經(jīng)元的人腦研究來說,我們還有很長的路要走,但能成功將AI引入工程巨大的神經(jīng)科學研究的海洋,對我們來說或許是開啟更復雜世界探索之旅的一個開始。

  附注

  該研究由西雅圖艾倫腦科學研究所和東南大學腦科學與智能技術(shù)研究院/東南大學-艾倫聯(lián)合研究中心聯(lián)合牽頭,彭漢川教授、曾紅葵教授領(lǐng)導的國內(nèi)外研究團隊共同參與。騰訊天衍實驗室作為論文共同完成單位和東南大學合作開發(fā)了AI糾錯技術(shù),協(xié)助科學家展開研究。


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